https://opendata.uni-halle.de//handle/497920112/159877 Mon, 06 Apr 2026 00:37:08 GMT 2026-04-06T00:37:08Z https://opendata.uni-halle.de//handle/1981185920/35512 Title: IGF2BP1 is the first positive marker for anaplastic thyroid carcinoma and an enhancer of a targetable gene expression signature Author(s): Haase, Jacob Abstract: Das anaplastische Schilddrüsenkarzinom (ATC) stellt immer noch eine Ausschlussdiagnose und das Malignom der Schilddrüse dar, welches am häufigsten zum Tode führt. Bisher sind keine Marker für eine eindeutige Diagnose und gezielte Therapien bekannt. Mittels retrospektiver Studie wird in dieser Arbeit das onkofötale IGF2 mRNA-Bindeprotein 1 (IGF2BP1) als erster Marker für das ATC beschrieben, um es eindeutig von anderen Malignomen der Schilddrüse zu unterscheiden. Weiterhin wird durch in vitro- und in vivo-Studien experimentell das onkogene Potenzial von IGF2BP1 als posttranskriptioneller Verstärker MYC-abhängiger Genexpression belegt. Dieser Wirkmechanismus stellt die Grundlage für eine gezielte Therapieoption durch BET-Inhibitoren dar. In vitro-Analysen solcher Inhibitoren untermauern ABBV-075 als hoch effiziente Option für ATC-Therapien dar. Eine Kombination von ABBV-075 mit einem Inhibitor gegen IGF2BP1 (BTYNB) in Synergie stellte sich als noch wirkungsvollere Strategie heraus.; Anaplastic thyroid carcinoma (ATC), still a diagnosis of exclusion, is the most lethal malignancy of the thyroid. Selective markers and drivers remain unknown, inhibiting advances in reliable diagnosis and treatment. In a retrospective study, this thesis unravels that the oncofetal IGF2 mRNA binding protein 1 (IGF2BP1) is the first exclusive marker for ATC, reliably distinguishing from other malignancies of the thyroid. Beyond its marker potential, IGF2BP1 is an oncogenic driver in ATC-derived cells, promoting rapid, invasive growth in vivo and in vitro. IGF2BP1 acts as a post-transcriptional enhancer of MYC-driven gene expression, providing a rationale for effective impairment by BET-inhibitors currently under FDA-evaluation. Comparative analyses of potency and efficacy suggest ABBV-075 as highly efficient first-line treatment option in ATC therapy. A combination of ABBV-075 with direct inhibition of IGF2BP1-function by BTYNB even further proves as a promising treatment strategy with synergistic effect. Wed, 01 Jan 2020 00:00:00 GMT https://opendata.uni-halle.de//handle/1981185920/35512 2020-01-01T00:00:00Z https://opendata.uni-halle.de//handle/1981185920/35241 Title: Unraveling the role of the RNA-binding protein MUSASHI1 in chemoresistance and malignancy of Glioblastoma Author(s): Pötschke, Rebecca Abstract: Das RNA-bindende Protein (RBP) Musashi1 (MSI1) ist ein postulierter Regulator der mRNA Translation verschiedener Zieltranskripte, wodurch es die Progression des Zellzyklus fördert. Das MSI1 Protein zeigt eine erhöhte Expression während der Embryogenese in Stammzellen, wo es die Fähigkeit der Selbsterneuerung der Stammzellen unterstützt und deren Differenzierungsprozess inhibiert. Das MSI1 Protein zeigt eine Re-Expression in verschiedenen Krebsarten, u.a. im Gehirntumor Glioblastom (GBM). Die hier vorliegende Studie identifiziert MSI1 als Regulator der stammzellartigen Eigenschaften des GBM und hebt die Kontrolle der mRNA Stabilität als neue Funktion für MSI1 hervor. Ebenso stellt die Arbeit Argumente für potentielle MSI1-abhängige Behandlungsoptionen für GBM bereit. Des Weiteren wurde eine bisher unentdeckte MSI1 Isoform beschrieben und charakterisiert.; The RNA-binding protein (RBP) Musashi (MSI1) is reported to control the mRNA translation of various target transcripts to promote cell cycle progression. It is highly abundant during embryogenesis in stem cells, where it was found to support stem cell self-renewal and to inhibit differentiation. MSI1 is upregulated in various cancers, with the highest expression in Glioblastoma (GBM), where it is presumed to promote an aggressive stemness-like tumor cell phenotype. The here presented data identify MSI1 as regulator of stemness in GBM and spots mRNA stability control as a new function for the well described translational modulator. The study provides rationales for potential treatment options for GBM. In addition to the presented data, an so far undescribed functional MSI1 protein isoform, resulting from alternative splicing, was identified. GBM samples as well as primary GBM-CSC also revealed the expression of this unknown MSI1 isoform. Wed, 01 Jan 2020 00:00:00 GMT https://opendata.uni-halle.de//handle/1981185920/35241 2020-01-01T00:00:00Z https://opendata.uni-halle.de//handle/1981185920/35117 Title: The mycobiome of symptomatic wood of Prunus trees in Germany Author(s): Bien, Steffen Abstract: Trotz ihrer Bedeutung bestehen große Wissenslücken bezüglich der Pilzgemeinschaften in symptomatischem Holz von ökonomisch bedeutenden Pflanzengruppen wie Steinobstgewächsen (Prunus spp.). Darüber hinaus ist die taxonomische Grundlage zur Artidentifikation vieler pathogener Pilze unklar. Um diese Wissenslücken zu schließen, wurde eine umfassende Untersuchung in Plantagen von Prunus avium, P. cerasus und P. domestica in drei wichtigen Obstanbaugebieten in Deutschland durchgeführt. Aus symptomatischem Holzgewebe isolierte und auf Nährböden kultivierte Pilze wurden anhand ihrer Morphologie und molekularer Daten untersucht. Ausgewählte Gattungen aus den Klassen Leotiomycetes und Eurotiomycetes wurden intensiv untersucht, z. T. unter Einbeziehung zusätzlicher Isolate aus anderen Studien. In diesem Zusammenhang konnten 15 Arten und sechs Gattungen neu beschrieben werden. Insgesamt wurden 172 Pilzarten isoliert, differenziert und zu einem großen Teil, anhand molekularer Verfahren, bis zur Gattungs- bzw. Artebene bestimmt.; Despite their importance, there are large gaps in knowledge regarding the fungal communities in symptomatic wood of economically important plant groups such as stone fruit plants (Prunus spp.). In addition, the taxonomic basis for identifying the species of many pathogenic fungi is unclear. In order to close these knowledge gaps, a comprehensive study was carried out in plantations of Prunus avium, P. cerasus and P. domestica in three important fruitproduction areas in Germany. Fungi isolated from symptomatic woody tissue and cultivated on nutrient media were examined on the basis of their morphology and molecular data. Selected genera from the classes Leotiomycetes and Eurotiomycetes have been intensively examined, in part including additional isolates from other studies. In this context, 15 species and six genera could be newly described. A total of 172 fungal species were isolated, differentiated and, to a large extent, determined up to the genus or species level using molecular methods. Wed, 01 Jan 2020 00:00:00 GMT https://opendata.uni-halle.de//handle/1981185920/35117 2020-01-01T00:00:00Z https://opendata.uni-halle.de//handle/1981185920/35102 Title: Gene discovery using high-throughput phenotyping under fluctuating growth conditions and rapid identification of mutated genes Author(s): Heuermann, Marc Christian Abstract: Pflanzen evolvierten unter fluktuierenden Licht- und dynamischen Umweltbedingungen, während sich die Pflanzenforschung hauptsächlich auf die Entdeckung von Genen unter konstanten, kontrollierten Wachstumsbedingungen konzentrierte. Der Hauptteil dieser Arbeit untersuchte die Reaktion von Arabidopsis auf fluktuierendes Licht in einer genomweiten Assoziationsstudie, in der festgestellt wurde, dass Arabidopsis in Photoprotektion und Instandhaltung des Photosystems investiert, die durch Phytochrom-Signale vermittelt werden, wodurch die Größe der Pflanzen negativ beeinflusst wird. In einer unterstützenden methodischen Weiterentwicklung wurde die Leistungsfähigkeit von Mais in simulierten feldähnlichen Umgebungen in der Pflanzenkulturhalle bewertet, die sich als überlegen gegenüber einem Gewächshaus erwies, die Leistung und Entwicklungsgeschwindigkeit von Feldpflanzen nachzuahmen. Parallel dazu wurde ein schnelles Kartierungsverfahren entwickelt, um die Geschwindigkeit der Vorwärtsgenetik in Nutzpflanzen zu erhöhen. Zwei EMS-induzierte Mutationen, rezessiv und dominant, wurden in Mais durch Nachkommenprüfung von individuell sequenzierten 32 Pflanzen direkt in der M2-Generation ohne die Notwendigkeit einer Rückkreuzung identifiziert.; Plants evolved under fluctuating light and dynamic environmental conditions, yet plant research so far mainly focused on gene discovery under constant, controlled growth conditions. The main part of this work explored Arabidopsis’ response to fluctuating light treatment in a genome-wide association study, which found that Arabidopsis invests into photoprotection and photosystem maintenance mediated by phytochrome signaling, thus negatively affecting the size of the plants. In a supporting methodical advancement, plant performance of maize under simulated field-like environments was evaluated in the Plant Cultivation Hall, which proved to be superior to a greenhouse to mimic performance and developmental speed of field grown plants. A rapid mapping procedure was developed in parallel to speed up forward genetics in crop populations. Two EMS-induced mutations, recessive and dominant, were identified in maize by progeny testing of individually sequenced 32 plants directly in the M2 generation without the need for backcrossing. Wed, 01 Jan 2020 00:00:00 GMT https://opendata.uni-halle.de//handle/1981185920/35102 2020-01-01T00:00:00Z